Клиническая подготовка обучающихся и практическая деятельность сотрудников кафедры гастроэнтерологии осуществляется на базе ведущих медицинских организаций города Алматы, оснащённых современной диагностической и лечебной инфраструктурой:
- Центральная городская клиническая больница (ЦГКБ);
- Городская больница скорой неотложной помощи (ГБСНП);
- Городская клиническая больница №7;
- Научный центр хирургии им. А.Н. Сызганова;
- Гепатологический центр;
- Детская клиническая больница №2 (ДКБ №2);
- Национальный центр педиатрии и детской хирургии (НЦПДХ);
- Interna Clinic.
Все преподаватели кафедры являются практикующими врачами-гастроэнтерологами и смежными специалистами, оказывающими специализированную и высокоспециализированную медицинскую помощь. Сотрудники кафедры активно работают на клинических базах, где:
- участвуют в клинических разборах и консилиумах;
- осуществляют ведение пациентов с гастроэнтерологической и гепатологической патологией;
- проводят консультативную помощь;
- участвуют в диагностических и лечебных эндоскопических вмешательствах;
- оказывают экстренную и плановую медицинскую помощь.
Интеграция учебного процесса с клинической практикой обеспечивает формирование у обучающихся современных профессиональных компетенций и практико-ориентированный подход к обучению.

