Кафедраның клиникалық базалары:
1) Алматы қаласының Қалалық кардиологиялық орталығы,
2)”Хирургия институты” ЖШС,
3) Перинатология және балалар кардиохирургиясы орталығы,
Алматы қ.
4) Алматы қаласының Орталық Қалалық Клиникалық ауруханасы
5) А. Н. Сызғанов атындағы ҰҒХО.
Кафедраның барлық оқытушылары жоғары мамандандырылған медициналық көмек көрсететін операциялық хирургтар болып табылады, клиникалық базаларда белсенді жұмыс істейді: клиникалық талдауларға, консилиумдарға қатысады, пациенттерді басқарумен айналысады, консультациялар, көшпелі шұғыл және жоспарлы операциялар жүргізеді.